Korištenje lijekova koji sadrže topiramat u trudnoći povećava rizik neuroloških razvojnih poremećaja kod djeteta. Upozorenje dolazi od Europske agencije za lijekove (EMA). Preporuka je da se ovaj lijek ne primjenjuje za prevenciju migrene ili kontrolu kilaže tijekom trudnoće. Navode i da pacijentice na ovoj terapiji, a koje mogu zatrudnjeti, moraju koristiti učinkovitu metodu kontracepcije.